小美和父亲史诺顿博士在绿色原野过着相依为命的生活。某日，博士在偶然之中得到了一块神秘的木刻板，并因此惹祸上身下落不明，留下小美一人过着孤单的生活。小美于无意之中在木刻板上排列的文字，竟然幻化成为了强大的“未知图腾”，为了抚慰小美孤单的心灵，未知图腾制造了美满的幻境令小美深陷其中，随着时间的推移，小美曾经的家被结晶包围，成为了一座结晶塔，而小美的心也渐渐变为冰冷的结晶。
　　为了满足小美“想要妈妈”的愿望，未知图腾绑架了小智的妈妈困于结晶塔之中，迫使小智不得不踏上拯救妈妈的旅途，然而，小美的心智早已经被污染殆尽，在她的眼中，小智就是一心想要破坏她幸福生活的最险恶的敌人。

江湖传言，飞贼风铃儿身边忽然多了一个神秘的白发少女，出手凌厉，不少黑道高手都在她手底下吃了亏。人们议论纷纷，这个少女究竟是谁，她一身武功又到底是从何而来，对于正道门派是福是祸。不过风铃儿和那白发少女—白钰袖倒并不在乎别人对她们的看法，依旧逍遥的游历江湖。殊不知一个巨大的阴谋正在她们背后酝酿...

原作小说是HONDA Super Cub总生产超过一亿辆的纪念作，故事舞台为山梨县北杜市，失去双亲、没有朋友与兴趣的少女「小熊」，与一台中古Super Cub 50相遇，透过摩托车而扩展自己的世界并逐渐成长。

“百武装展开！！”
　　“HUNDRED”──那是能对抗袭击地球的神祕生物“蛮族”（Savage）的唯一武器。
　　主角如月隼人为了成为能够驾驭HUNDRED的武艺者（Slayer），进入海上学园都市舰“Little Garden”就读。然而──
　　“我好想你喔，隼人!!”
　　“你、你到底是……？”
　　对於似乎很了解自己的室友艾米尔‧克劳福德，隼人产生了某种怀念的异样感受。不仅如此，才一入学，学园最强的武艺者“女王”克蕾亚‧哈维便向他提出决斗要求……!?
　　箕崎准(ocelot)×大熊猫介（Nitro+）联手推出！“究极”学园风动作小说，就此开幕！

照常进行修业之旅的小智（松本梨香 配音）、小刚（上田祐司 配音）、小霞（饭塚雅弓 配音）一行辗转来到水之都奥多马雷参加紧张刺激的水上竞赛。奥多马雷流传着一个精彩的传说，在很久很久以前，岛上的老夫妇捡到一对孤儿兄妹，当邪魔出现时，两兄妹化作威力强大的神奇宝贝拉帝欧斯和拉帝亚斯，他们击败邪魔，并赐予奥多马雷人民名为“心灵水滴”的宝石作为守护。时至今日，神圣的心灵之滴却引起一对盗贼姐妹（释由美子 配音）的垂涎。她们在追踪妹妹拉帝亚斯（折笠富美子 配音）时遭遇小智并受挫，贪欲将带给水都史无前例的灾难……
　　本片为神奇宝贝系列第五部电影剧场版。

千年一次的彗星之夜里，愿望将会实现……　　立志成为出色的神奇宝贝训练师的小智、小遥和小胜，带着皮卡丘展开了新的旅程。为了观看千年彗星出现的刹那，来到恩斯游乐场，并认识魔术师巴特勒与戴安。在魔术表演中，小胜听到一阵细微的呼唤声…　　那是在〝沉眠之茧〞中沉睡了千年，可帮助人类达成愿望的神奇宝贝——基拉祈。在千年彗星出现的夜晚，如果遇到拥有纯真心灵的伙伴便会苏醒。为了让基拉祈醒来，巴特勒请小胜当基拉祈的伙伴，果然，基拉祈从万花镜般的光芒中苏醒过来。　　虽然基拉祈只能停留短暂的七日就会再消失，但是头一次拥有属于自己的神奇宝贝的小胜，对基拉祈却非常宠爱。充满野心的魔术师巴特勒，因为知道基拉祈具有神奇的力量，便把基拉祈给抢走，并且想利用他来完成愿望。　　不怀好意的巴特勒，他的愿望是什么呢？小智与小胜要如何克服困难，成功救出同伴呢？小胜与基拉祈又会面临怎样的生离死别呢？